根據(jù)《關(guān)于全面推開營業(yè)稅改征增值稅試點有關(guān)稅收征收管理事項的公告》（國家稅務(wù)總局2016年第23號公告），納稅人在地稅發(fā)生稽查查補(bǔ)稅款未開具發(fā)票，2016年5月1日以后需要補(bǔ)開發(fā)票的，可于2016年12月31日前開具增值稅普通發(fā)票（稅務(wù)總局另有規(guī)定的除外）。

貴公司2013年與對方發(fā)生的業(yè)務(wù)仍屬于營業(yè)稅征收范圍，營改增后可以按照規(guī)定開具增值稅普通發(fā)票，不能開具增值稅專用發(fā)票。對方以此為理由拒開發(fā)票，不符合營改增的相關(guān)規(guī)定。另外，對方如果此項業(yè)務(wù)已申報納稅營業(yè)稅但未開具發(fā)票則不涉及滯納金和罰款，如果對方即未申報也沒有開票，可能會涉及地稅稽查查補(bǔ)的風(fēng)險。對方不開票的顧慮可能存在以上情況。

鑒于貴公司沒有發(fā)票，根據(jù)企業(yè)所得稅稅前扣除辦法規(guī)定，納稅人申報的扣除要真實、合法。真實是指能提供證明有關(guān)支出確屬已經(jīng)實際發(fā)生的適當(dāng)憑據(jù)；合法是指符合國家稅收規(guī)定，其他法規(guī)規(guī)定與稅收法規(guī)規(guī)定不一致的，以稅收法規(guī)規(guī)定為準(zhǔn)。您沒有發(fā)票是不允許列支和稅前扣除的，匯算清繳需要納稅調(diào)增。謝謝您的提問，最后提示：追要發(fā)票是正道（2016年12月31日前可以補(bǔ)開，過期不再允許，請注意期限），補(bǔ)償稅款得不償失，請斟酌。