工程監(jiān)理企業(yè)如為增值稅一般納稅人，可以取得增值稅專用發(fā)票等增值稅扣稅憑證抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額，同其他行業(yè)納稅人的做法一樣。

2016年4月30日前，工程監(jiān)理是否屬于營改增范圍，各地有不同口徑。2016年5月1日之后，依據(jù)《銷售服務(wù)、無形資產(chǎn)或者不動產(chǎn)注釋》表，工程監(jiān)理屬于鑒證咨詢服務(wù)當(dāng)中的鑒證服務(wù)，增值稅一般納稅人適用的稅率是6%。

1、增值稅扣稅憑證

增值稅扣稅憑證包括增值稅專用發(fā)票、的海關(guān)進(jìn)口增值稅專用繳款書、代扣代繳境外增值稅的完稅憑證、路橋費(fèi)發(fā)票（2016年5-7月）等。

根據(jù)財(cái)稅[2016]36號附件1第二十五條，下列進(jìn)項(xiàng)稅額準(zhǔn)予從銷項(xiàng)稅額中抵扣：

（一）從銷售方取得的增值稅專用發(fā)票（含稅控機(jī)動車銷售統(tǒng)一發(fā)票，下同）上注明的增值稅額。

（二）從海關(guān)取得的海關(guān)進(jìn)口增值稅專用繳款書上注明的增值稅額。

（三）購進(jìn)農(nóng)產(chǎn)品，除取得增值稅專用發(fā)票或者海關(guān)進(jìn)口增值稅專用繳款書外，按照農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票或者銷售發(fā)票上注明的農(nóng)產(chǎn)品買價(jià)和13%的扣除率計(jì)算的進(jìn)項(xiàng)稅額。計(jì)算公式為：

進(jìn)項(xiàng)稅額=買價(jià)×扣除率

買價(jià)，是指納稅人購進(jìn)農(nóng)產(chǎn)品在農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票或者銷售發(fā)票上注明的價(jià)款和按照規(guī)定繳納的煙葉稅。

購進(jìn)農(nóng)產(chǎn)品，按照《農(nóng)產(chǎn)品增值稅進(jìn)項(xiàng)稅額核定扣除試點(diǎn)實(shí)施辦法》抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額的除外。

（四）從境外單位或者個人購進(jìn)服務(wù)、無形資產(chǎn)或者不動產(chǎn)，自稅務(wù)機(jī)關(guān)或者扣繳義務(wù)人取得的解繳稅款的完稅憑證上注明的增值稅額。

依據(jù)《關(guān)于進(jìn)一步明確全面推開營改增試點(diǎn)有關(guān)勞務(wù)派遣服務(wù)、收費(fèi)公路通行費(fèi)抵扣等政策的通知》（財(cái)稅〔2016〕47號 ）規(guī)定，2016年5月1日至7月31日，一般納稅人支付的道路、橋、閘通行費(fèi)，暫憑取得的通行費(fèi)發(fā)票（不含財(cái)政票據(jù)）上注明的收費(fèi)金額按照下列公式計(jì)算可抵扣的進(jìn)項(xiàng)稅額：

高速公路通行費(fèi)可抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額=高速公路通行費(fèi)發(fā)票上注明的金額÷（1+3%）×3%

一級公路、二級公路、橋、閘通行費(fèi)可抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額=一級公路、二級公路、橋、閘通行費(fèi)發(fā)票上注明的金額÷（1+5%）×5%

通行費(fèi)，是指有關(guān)單位依法或者依規(guī)設(shè)立并收取的過路、過橋和過閘費(fèi)用。

1、 特定情況不能抵扣進(jìn)項(xiàng)

根據(jù)財(cái)稅[2016]36號文第二十七條規(guī)定，下列項(xiàng)目的進(jìn)項(xiàng)稅額不得從銷項(xiàng)稅額中抵扣：

（一）用于簡易計(jì)稅方法計(jì)稅項(xiàng)目、免征增值稅項(xiàng)目、集體福利或者個人消費(fèi)的購進(jìn)貨物、加工修理修配勞務(wù)、服務(wù)、無形資產(chǎn)和不動產(chǎn)。其中涉及的固定資產(chǎn)、無形資產(chǎn)、不動產(chǎn)，僅指專用于上述項(xiàng)目的固定資產(chǎn)、無形資產(chǎn)（不包括其他權(quán)益性無形資產(chǎn)）、不動產(chǎn)。

納稅人的交際應(yīng)酬消費(fèi)屬于個人消費(fèi)。

（二）非正常損失的購進(jìn)貨物，以及相關(guān)的加工修理修配勞務(wù)和交通運(yùn)輸服務(wù)。

（三）非正常損失的在產(chǎn)品、產(chǎn)成品所耗用的購進(jìn)貨物（不包括固定資產(chǎn)）、加工修理修配勞務(wù)和交通運(yùn)輸服務(wù)。

（四）非正常損失的不動產(chǎn)，以及該不動產(chǎn)所耗用的購進(jìn)貨物、設(shè)計(jì)服務(wù)和建筑服務(wù)。

（五）非正常損失的不動產(chǎn)在建工程所耗用的購進(jìn)貨物、設(shè)計(jì)服務(wù)和建筑服務(wù)。

納稅人新建、改建、擴(kuò)建、修繕、裝飾不動產(chǎn)，均屬于不動產(chǎn)在建工程。

（六）購進(jìn)的旅客運(yùn)輸服務(wù)、貸款服務(wù)、餐飲服務(wù)、居民日常服務(wù)和娛樂服務(wù)。

（七）財(cái)政部和國家稅務(wù)總局規(guī)定的其他情形。

本條第（四）項(xiàng)、第（五）項(xiàng)所稱貨物，是指構(gòu)成不動產(chǎn)實(shí)體的材料和設(shè)備，包括建筑裝飾材料和給排水、采暖、衛(wèi)生、通風(fēng)、照明、通訊、煤氣、消防、中央空調(diào)、電梯、電氣、智能化樓宇設(shè)備及配套設(shè)施。