學員，您好：
對于你描述的管理公司與門店之間，是總分公司的關系？投資與被投資之間的關系？還是行政上的管理與被管理的關系？不同情況下的核算處理是不一樣的。但總的納稅處理原則不會有太大的差異。
1.總部對新增的中央廚房和配送中心的賬務該如何處理？
答：對于總部的中央廚房和配送中心在與各門店進行業(yè)務往來的時，應符合獨立交易的原則，同時需要簽訂服務合同。也就是說對稅務來講，你就按正常的業(yè)務處理就好?？偛吭撍闶杖胗嬍杖耄撍愠杀居嫵杀?，至于你收到管理費，必須要有提供實際的管理服務，同時要簽訂服務協(xié)議，當然也需要開具發(fā)票。
2.對各門店的配送（加價或不加價都行），總部該如何合理奉賢合規(guī)？
答：至于你提到的奉賢合規(guī)問題，首先必須對你企業(yè)的實際操作流程進行全面的了解后才能作出合規(guī)，但加價與不加價與收不收管理費或代理費等形式之間是有一定的關系的。因此，還得根據(jù)你企業(yè)的實際情況分析，建議你請專業(yè)的咨詢公司到企業(yè)去全面了解后進行合規(guī)。
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財稅【2016】36號文營改增政策，主要是將營業(yè)稅改征增值稅，對于企業(yè)所得稅、個人所得稅等其他稅費沒有直接影響（主要是財稅[2016]43號關于計稅依據(jù)的變化）
就建筑而言，通常會有以下影響：
1、對票據(jù)的管理更為嚴格
營改增之前，建筑業(yè)勞務，直接在勞務發(fā)生地開具發(fā)票、繳納營業(yè)稅，操作起來相對方便，且地方稅務局征收完營業(yè)稅之后，對于建筑企業(yè)采購端的費用、票據(jù)管理并不嚴格。營改增之后，各個環(huán)節(jié)對增值稅的要求較高，如選用一般計稅方式，按規(guī)定計算銷項稅額之后，相應的進項需要取得專票抵扣。
上述變化，會進一步規(guī)范企業(yè)的運作，營改增之前類似的掛靠收取管理費等違規(guī)行為，在營改增之后的操作空間更少，對于規(guī)范運作的企業(yè)更為有利。
2、納稅申報方式變化
營改增之前，營業(yè)稅在勞務發(fā)生地申報納稅，營改增之后，企業(yè)提供建筑服務，按規(guī)定需要在勞務發(fā)生地預繳增值稅，之后還需要在機構的申報繳納增值稅（具體查看國家稅務總局2016年第17號公告）。
3、報價方式變化
不論是銷售環(huán)節(jié)還是采購（分包環(huán)節(jié)），由于營業(yè)稅改征增值稅后的變化，對相應的收入、成本需要另外測算，報價需做相應調整，如上海市發(fā)布的《關于建筑業(yè)營業(yè)稅改征增值稅調整上海市建設工程計價依據(jù)的實施意見》（京建發(fā)[2016]116號），企業(yè)需要依據(jù)當?shù)匕l(fā)布的政策作出相關調整。
更多分析，可以查看廣東國稅發(fā)布的《建筑業(yè)稅負只減不增政策指引》http://www.gd-n-tax.gov.cn/pub/gzsgsww/bsfw/bszt/ygz/xcfd/201605/t20160503_910286.html
建議熟悉上述相關政策后，我們再就具體的問題進行分析討論。
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